汕头港务集团有限公司内部管理机构设置行政办公室、运输业务部、财务部、人力资源部、技术安全部、工程部、物资部、党委工作部（内设武装部）、纪委（内设审计室）、工会等10个部门。
（1）行政办公室
主要职责：行政、文秘、体改、政策研究、法律事务、保密、综合协调和后勤事务。
联系电话：88932266
（2）运输业务部
主要职责：货源与装卸生产组织、商务、货运管理、安全生产、信息管理和质量体系管理。
联系电话：88932214
（3）财务部
主要职责：财务管理、会计核算、物资供应管理、资本营运、资产管理和住房基金管理。
联系电话：88932263
（4）人力资源部
主要职责：人事管理（含干部管理、老干部管理）、劳动管理、职改、教育培训、社会保险和计划生育工作。
联系电话：88932220
（5）技术安全部
主要职责：机械设备、船舶管理、装卸工艺、科技、安全、计量、能源管理、劳动保护、环境保护、物资计划、采购、供应、库存、调拨、报废、转让、处置进行全过程的指导，协调，监督和管理。
联系电话：88932284
（6）工程部
主要职责：基础设施建设、维护、管理。
联系电话：88932217
（7）党委工作部
主要职责：党的建设、精神文明建设、思想政治工作、共青团、统战和信访工作。
内设武装部，主要职责：民兵、预备役、国防交通战备、拥军优属和人民防空。
联系电话：88932205
（8）纪委（审计室）
主要职责：纪律检查、党风廉政建设、党纪党规教育、行风建设。
内设审计室，主要职责：内部审计监督。
联系电话：88932251
（9）工会
主要职责：民主管理、劳动竞赛、劳动调解、女工、退休职工管理。
联系电话：88932230